Innocenzo III Lotario Conti di Segni

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Rocca Orsini di Trevignano Romano

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Sant'Agnese fuori le mura
Restauri.

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San Sisto vecchio a via appia
1198 - 1216: Ricostruzione: la fabbrica paleocristiana viene interrata mantenendo soltanto l'abside; nuova struttura ricostruita tre metri sopra ad unica navata con un nuovo campanile.

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Santa Prassede all'esquilino
1198: Affida il complesso ai monaci di Vallombrosa

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Santi Celso e Giuliano in Banchi
1198: Crea la chiesa come cappella papale.

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Santi Michele e Magno
1198: Viene ribadita la dipendenza della chiesa dal Capitolo di S.Pietro in qualità di chiesa filiale.

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Santa Pudenziana al viminale
1199: Commissiona il campanile e la Schola Cantorum cosmatesca (distrutta durante i restauri del cardinale Enrico Caetani)

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Arcispedale di Santo Spirito in Saxia
1201: Con un breve pontificio, sancisce la prima fondazione dell'ospedale.

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Tor de Conti
1203: Costruzione su rovine del Foro della Pace.

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Antica basilica di San Pietro in Vaticano
1205 - 1212: Nuova decorazione musiva per l'abside della basilica.

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San Saba
1205: Nuovo pavimento e portale Cosmatesco.

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Ospedale dei Trinitari
1209: Il complesso ospedaliero viene affidato a San Giovanni de Matha ed al suo ordine appena approvato, i Trinitari.

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San Tommaso in Formis
1209: Il complesso ospedaliero viene affidato a San Giovanni de Matha ed al suo ordine appena approvato, i Trinitari.

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Sant'Anastasia al palatino
1210: Aggiunta di due amboni.

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San Crisogono
1213: Affida la chiesa ai canonici regolari del Salvatore.

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San Giorgio in Velabro
1190 - 1198: Cardinale diacono.

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Santi Sergio e Bacco al Foro Romano
1190 - 1198: Cardinale diacono.

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Cattedrale di San Giovanni in Laterano